--- a/make/Makefile.pcom +++ b/make/Makefile.pcom @@ -216,14 +216,14 @@ $(CC) -o print_pssm $(CFLAGS) print_pssm.c getseq.c karlin.c apam.c pssm_asn_subs.c $(LIB_M) $(LIB_DB) map_db : map_db.c uascii.h ncbl2_head.h - $(CC) $(CFLAGS) -o $(BIN)/map_db map_db.c + $(CC) $(CFLAGS) $(HFLAGS) $(BIN)/map_db map_db.c list_db : list_db.c - $(CC) $(CFLAGS) -o $(BIN)/list_db list_db.c + $(CC) $(CFLAGS) $(HFLAGS) $(BIN)/list_db list_db.c lav2ps : lav2plt.o lavplt_ps.o - $(CC) -DUNIX -o $(BIN)/lav2ps lav2plt.o lavplt_ps.o -lm + $(CC) -DUNIX $(HFLAGS) $(BIN)/lav2ps lav2plt.o lavplt_ps.o -lm lav2svg : lav2plt.o lavplt_svg.o - $(CC) -DUNIX -o $(BIN)/lav2svg lav2plt.o lavplt_svg.o -lm + $(CC) -DUNIX $(HFLAGS) $(BIN)/lav2svg lav2plt.o lavplt_svg.o -lm --- a/make/Makefile.pcom_s +++ b/make/Makefile.pcom_s @@ -149,14 +149,14 @@ $(CC) -o print_pssm $(CFLAGS) print_pssm.c getseq.c karlin.c apam.c pssm_asn_subs.c $(LIB_M) $(LIB_DB) map_db : map_db.c uascii.h ncbl2_head.h - $(CC) $(CFLAGS) -o $(BIN)/map_db map_db.c + $(CC) $(CFLAGS) $(HFLAGS) $(BIN)/map_db map_db.c list_db : list_db.c - $(CC) $(CFLAGS) -o $(BIN)/list_db list_db.c + $(CC) $(CFLAGS) $(HFLAGS) $(BIN)/list_db list_db.c lav2ps : lav2plt.o lavplt_ps.o - $(CC) -DUNIX -o $(BIN)/lav2ps lav2plt.o lavplt_ps.o -lm + $(CC) -DUNIX $(HFLAGS) $(BIN)/lav2ps lav2plt.o lavplt_ps.o -lm lav2svg : lav2plt.o lavplt_svg.o - $(CC) -DUNIX -o $(BIN)/lav2svg lav2plt.o lavplt_svg.o -lm + $(CC) -DUNIX $(HFLAGS) $(BIN)/lav2svg lav2plt.o lavplt_svg.o -lm --- a/make/Makefile.pcom_t +++ b/make/Makefile.pcom_t @@ -171,14 +171,14 @@ $(CC) -o print_pssm $(CFLAGS) print_pssm.c getseq.c karlin.c apam.c pssm_asn_subs.c $(LIB_M) $(LIB_DB) map_db : map_db.c uascii.h ncbl2_head.h - $(CC) $(CFLAGS) -o $(BIN)/map_db map_db.c + $(CC) $(CFLAGS) $(HFLAGS) $(BIN)/map_db map_db.c list_db : list_db.c - $(CC) $(CFLAGS) -o $(BIN)/list_db list_db.c + $(CC) $(CFLAGS) $(HFLAGS) $(BIN)/list_db list_db.c lav2ps : lav2plt.o lavplt_ps.o - $(CC) -DUNIX -o $(BIN)/lav2ps lav2plt.o lavplt_ps.o -lm + $(CC) -DUNIX $(HFLAGS) $(BIN)/lav2ps lav2plt.o lavplt_ps.o -lm lav2svg : lav2plt.o lavplt_svg.o - $(CC) -DUNIX -o $(BIN)/lav2svg lav2plt.o lavplt_svg.o -lm + $(CC) -DUNIX $(HFLAGS) $(BIN)/lav2svg lav2plt.o lavplt_svg.o -lm